肿瘤突变负荷TMB
通过基因检测来判断外显子区每百万碱基上的体细胞突变,包括碱基替换、插入或缺失等。临床研究表明,TMB(Tumor Mutation Burden)越高,越适合进行免疫治疗;反之TMB越低,越不适合做免疫治疗。2017年12月,新英格兰杂志发表文章研究了27种不同类型的肿瘤中抗PD-1或抗PDL1治疗的肿瘤突变负荷,与客观反应率之间存在正相关性[2]。
肿瘤新生抗原负荷TNB
非同义突变通常会导致氨基酸编码序列发生变化,导致肿瘤细胞表达蛋白发生异常;而引起T细胞活化的异常蛋白,称为“新生抗原”。基因组和转录组层面检测能够较为全面地鉴定新生抗原,准确地定量TNB(Tumor Neoantigen Burden),并应用于临床[3]。TNB越高,越适合进行
免疫治疗;反之TMB越低,则不适合做免疫治疗;新生抗原序列可作为肿瘤疫苗、细胞免疫治疗的抗原依据。
错配修复缺陷/微卫星不稳定性 dMMR/MSI
MMR基因是DNA错配修复基因,其表达缺失可引起DNA复制过程中发生错配,并累积导致微卫星不稳定性(MicroSatellite Instability, MSI)的发生;具有错配修复缺陷(MisMatch Repair deficient, dMMR)或微卫星高不稳定性(MSI-H)的肿瘤患者,其癌症基因组含有相对较高的体细胞突变,适合进行免疫治疗[4]。
肿瘤免疫治疗作为目前热门的肿瘤治疗手段之一,在黑色素瘤、非小细胞肺癌等多种癌症治疗中取得喜人效果。但肿瘤免疫治疗也存在瓶颈,例如具有抗原呈递机器缺陷(Antigen Presentation Machinery, APM),采取免疫治疗存在更高的耐药风险[5];具有EGFR/MDM2/MDM4变异,进行免疫治疗会存在加速肿瘤生长速度的风险[6],足见癌症免疫治疗还有很大的研究空间。
参考文献
[1] Precision medicine and cancer immunology in China. Science. 2018,359(6375), pp.598.
[2] Yarchoan M, Hopkins A, Jaffee EM. Tumor Mutational Burden and Response Rate to PD-1 Inhibition[J]. N Engl J Med. 2017,377(25):2500-2501.
[3] Gubin MM, Artyomov MN, et al. Tumor neoantigens: building a framework for personalized cancer immunotherapy[J]. J Clin Invest.2015,125(9):3413-21.
[4] Grasso CS, Giannakis M, et al. Genetic mechanisms of immune evasion in colorectal cancer[J].Cancer Discov. 2018,pii: CD-17-1327.
[5] Leone P, Shin EC, et al. MHC Class i Antigen Processing and Presenting Machinery:Organization, Function, and Defects in Tumor Cells[J]. J Natl Cancer Inst. 2013,105(16):1172-87.
[6] Kato S, Goodman A, et al. Hyper-progressors after Immunotherapy: Analysis of Genomic Alterations Associated with Accelerated Growth Rate[J]. Clin Cancer Res. 2017,23(15):4242-4250.